Фондация „Национален съвет за журналистическа етика” е учредена през 2005 година с цел да създаде система за саморегулиране на печатните и електронни медии в България, чрез тълкуването и прилагането на Етичния кодекс на българските медии и решаването на споровете между медиите и тяхната аудитория. Съучредители на фондацията са Асоциацията на българските радио и телевизионни оператори АБРО, Българската медийна коалиция, Съюзът на издателите в България, Съюзът на българските журналисти и Фондация “Център за развитие на медиите”.
Основно задължение на НСЖЕ е да създаде Комисии за етика, които да следят за   спазването на Етичния кодекс като разглеждат и се произнасят по индивидуални жалби на граждани и организации. Пряката цел на Фондацията се изразява в създаване на достъпна, ясна, безплатна и бърза процедура за подаване и разглеждане на жалби граждани и организации срещу печатни и електронни медии, подписали Етичния кодекс.
Процеса по конституиране на Комисиите за етика започва в края на 2005 и завършва с приемането на Правилник за дейността на Комисията за етика в печата и Комисията за етика в електронните медии (март 2006 г.) и със създаването на необходимите материално-технически условия за осъществяването на дейността (май 2006 г.). Комисиите приемат жалби от юни 2006 г.
В по-широк план целта на ФНСЖЕ и Комисиите за етика е чрез утвърждаването на единни професионални стандарти и популяризиране на медийната саморегулация и правото на засегнатите лица на жалба, да спомогне за формиране на информационна култура на българския читател и създаване на необходимост от търсене на точна, проверена и балансирана информация, да повиши доверието в медиите, но и тяхната отговорност. Чрез разглеждането на индивидуални жалби на граждани и чрез утвърждаването на високи професионални журналистически стандарти, комисиите защитават залегналите в Конституцията на Република България комуникационни права и свободи на българските граждани.
 Фондация НСЖЕ и създадените към нея Комисии за етика са част от мрежата на Независимите Прессъвети в Европа – Alliance of Independent Press Сouncils of Europe.